Le gouvernement régional travaille actuellement avec les ONG et les communautés philanthropiques pour passer d'une initiative pilotée par des ONG internationales et financée par des donateurs à une initiative gérée entièrement par des institutions locales et financée de manière durable. Une fois qu'il aura réussi, il s'agira du premier réseau d'AMP indonésien entièrement financé de manière durable et il servira de modèle dans tout le pays et dans toute la région. La viabilité financière du réseau d'AMP sera assurée par des sources de revenus diversifiées, notamment des allocations gouvernementales, des droits d'entrée et d'autres mécanismes de financement locaux, des collectes de fonds locales et un fonds fiduciaire dédié à la conservation. La coalition BHS a élaboré un modèle de coûts et un plan d'affaires complets qui prévoient les coûts, les revenus et les lacunes du paysage marin dans le cadre d'un système de gestion "stable" qui devrait être en place d'ici 2017. Plus de 70 % des coûts locaux sont déjà couverts par des sources locales, le plus grand contributeur étant le gouvernement lui-même. Bien que ces engagements locaux soient sans précédent, des investissements supplémentaires sont nécessaires pour garantir un paysage marin doté de ressources durables. La coalition travaille avec le gouvernement provincial pour développer un fonds fiduciaire dédié, le Blue Abadi Fund, afin de combler cette lacune.

Les communautés locales de Cagayancillo sont indemnisées pour les pertes économiques causées par les politiques d'interdiction de pêche. Une partie des droits de conservation est affectée à un fonds de subsistance qui fournit des prêts pour le développement.

Le parc naturel des récifs de Tubbataha (TRNP) est géré avec l'aide financière de diverses sources. Les droits de conservation payés par les visiteurs constituent la principale source de financement, avec 74 % du budget annuel. Les subventions des ONG et du secteur privé représentent les 26 % restants. Ces fonds sont déposés dans un fonds fiduciaire local géré par le conseil de gestion de la zone protégée de Tubbataha et utilisés uniquement pour l'administration du parc.

Les institutions et les communautés locales, les représentants des gouvernements municipaux et nationaux, les ONG, les universités et le secteur privé sont tous représentés au sein d'un organe local de gestion du parc et d'application de la loi. L'application de la loi est assurée grâce à des partenariats avec la marine et les garde-côtes philippins et des gardes forestiers recrutés localement qui reçoivent une formation approfondie et un équipement de surveillance approprié. La situation environnementale du parc fait l'objet d'un suivi régulier, tandis que l'efficacité de la gouvernance est mesurée chaque année à l'aide de mécanismes participatifs.

Afin de promouvoir la sensibilisation et la compréhension générale de l'importance mondiale de ce point chaud de la biodiversité, la loi et les politiques élaborées sont communiquées au public par le biais de diverses activités de sensibilisation, par exemple par le biais d'annonces à la radio et dans les journaux locaux.

Une série de consultations et d'ateliers multipartites visant à rédiger et à réviser la loi a permis d'assurer la pleine participation des parties prenantes et de favoriser le respect des réglementations. Le règlement intérieur de la loi a depuis été revu et mis à jour à plusieurs reprises et comprend désormais des politiques sur la recherche sur les écosystèmes, le tourisme et le plan de gestion de la zone tampon. Il a été communiqué au public par le biais d'activités de sensibilisation. Des formations et des campagnes d'information ont favorisé la prise de conscience et la compréhension de l'importance mondiale de ce point chaud de la biodiversité.