Zwischen 2003 und 2010 wurden mehrere Pilotprogramme zur Förderung des ökologischen Landbaus aufgelegt, darunter die Einrichtung von Bio-Dörfern, in denen die Landwirte in ökologischen Anbaumethoden und der Herstellung von organischen Betriebsmitteln wie Kompostierung, organischem Dünger und organischen Pestiziden unter Verwendung lokaler Pflanzen und Kuhurin geschult wurden. In diesem Zeitraum investierte die Regierung auch erheblich in den Bau von Kompostieranlagen. Bis 2009 profitierten mehr als 100 Dörfer von diesen Programmen, die 10.000 Landwirte in allen vier Distrikten des Bundesstaates erreichten.

Im Rahmen der 2010 gestarteten Sikkim Organic Mission wurden eine Reihe weiterer Maßnahmen zur Förderung der ökologischen Landwirtschaft durchgeführt, darunter der Aufbau von Kapazitäten, die Produktion von ökologischem Saat- und Pflanzgut, die Einrichtung eines Labors für Saatgut- und Bodentests, der Betrieb eines Sikkim Organic Retail Outlets in Neu-Delhi, die Aufnahme des ökologischen Landbaus in die Lehrpläne der Schulen, die Umwandlung der beiden staatlichen Bauernhöfe in Nazitam und Mellidara in ökologische Kompetenzzentren für die Durchführung von Demonstrationen und Versuchen im ökologischen Landbau sowie die Einrichtung von drei Schulen zur Förderung des Lebensunterhalts als Ausbildungszentren für arbeitslose Jugendliche.