El acuerdo de cogestión está sujeto a modificaciones durante el proceso de aprendizaje práctico. Los actores clave involucrados en la gobernanza compartida deben comprender la necesidad de modificar el acuerdo en base a las lecciones aprendidas durante la implementación. El acuerdo de manejo conjunto proporciona los principios básicos para la asociación de manejo conjunto entre los actores clave, pero no limita su colaboración en la toma de decisiones conjuntas a los términos y problemas específicos mencionados en el acuerdo. Los socios, tales como las autoridades y las comunidades, deben seguir discutiendo y tratando cualquier asunto que surja durante su asociación. El acuerdo de cogestión no es lo mismo que una forma fija de mecanismo de reparto de beneficios, aunque conste de secciones que especifiquen qué recursos pueden recolectar las personas y sus responsabilidades en la protección del bosque. En cambio, un acuerdo de cogestión es el resultado de negociaciones y tiene mucho que ver con la gestión adaptativa y las cuestiones de gobernanza.

• En los países donde la gestión centralizada se ha practicado durante años, las comunidades suelen estar formadas por individuos pasivos que viven unos al lado de otros. Ponerlas a tomar decisiones conjuntas con las autoridades sin darse cuenta de este hecho es un error que hay que evitar. Estas comunidades necesitan apoyo para organizarse, aprender y reforzar su sentido de la identidad y su relación con la zona. Delegar las tareas de dirección de la comunidad pasiva en los líderes locales (previa formación de estos líderes) es una práctica habitual, pero creará problemas más adelante.
• El apoyo externo sólo debe centrarse en facilitar el proceso de negociación. Las cuestiones comunes identificadas y debatidas en el proceso de negociación deben ser el resultado del autoanálisis de los actores.
• La negociación entre los actores clave debe continuar incluso después de la firma del acuerdo. El reparto de poder no debe detenerse con el primer acuerdo de cogestión. Los actores deben seguir renegociando y mejorando el acuerdo.

• Aprovechar la experiencia de los becarios y animarles a autoorganizarse en torno a proyectos de aprendizaje y acción (dotados de recursos) les ayuda a desarrollar su capacidad de liderazgo.
• Los proyectos de los becarios tienen más probabilidades de éxito si forman parte del plan de trabajo de su organización.
• La financiación inicial es necesaria para poner en marcha los proyectos.

Según nuestra experiencia, es necesaria una "socialización" inicial (suministro, introducción y comunicación) de la información y los principios básicos del carbono azul a través de reuniones formales e informales con funcionarios del país en múltiples niveles de toma de decisiones. A continuación, debe considerarse una clara comprensión de las necesidades y prioridades actuales del país, y cómo pueden satisfacerse mediante acciones de carbono azul, para garantizar que el proceso sea compatible con los procesos nacionales en curso y los compromisos internacionales en materia de cambio climático y conservación. El papel de las personas que facilitan el proceso político es clave para ofrecer información sólida, comprender las necesidades de los países, garantizar que se satisfacen los intereses de los diferentes actores, negociar asuntos complejos y mediar en los conflictos que puedan surgir. El ritmo al que los gobiernos responden a procesos específicos no es necesariamente compatible con los objetivos a corto plazo del desarrollo y la ejecución de proyectos locales o la cooperación internacional.

La percepción local de lo que constituye un servicio ecosistémico "prioritario" para su valoración puede diferir de la de los promotores e investigadores del proyecto. Además, la escasez de datos puede limitar el alcance del estudio de valoración. Por tanto, puede ser necesario negociar con la población local durante la fase de diagnóstico preliminar qué servicios satisfacen sus necesidades y las del proyecto, y cuáles pueden valorarse. La amplia gama de servicios que prestan los manglares y los ecosistemas costero-marinos circundantes hace que un ejercicio de valoración completo sea muy difícil. Por ello, la mayoría de los estudios de valoración son parciales y dependen de una serie de supuestos y de una variedad de métodos diferentes. Es muy ventajoso tener buenas relaciones de trabajo con los representantes del gobierno encargados del procesamiento y archivo de datos, así como una sólida comprensión de los detalles de los medios de subsistencia y los modelos empresariales locales, razón por la cual debe realizarse paralelamente un estudio de los medios de subsistencia.