多元治理委员会通常由地方当局、政府部门和机构、地方社区，有时还有商业组织的代表组成，在谈判过程中成立。委员会负责就自然资源保护方面提出的问题共同做出决定。其作用是指导共同管理协议的实施，并根据监测结果审查共同管理的成果和影响。多元治理委员会是将 "权力共享 "理念从理论转化为实践的重要因素。这区别于只有一个合作伙伴承担决策责任的集中管理或私人管理。

共同管理协议是一份文件，包含谈判过程中达成的所有协议，包括管理和治理要素。它可以被视为当地参与者之间伙伴关系的书面证据。管理部分规定了六个 "W"：谁能做什么、在哪里做、何时做、如何做以及做多少。它规定了一般条件；明确了每个区域的自然资源管理规章制度、奖励、惩罚、报告时间表、执行条款和监督。治理部分规定了决策的主要参与者及其责任。

中美洲珊瑚礁生态区领导力计划旨在将新的项目理念培育成有可能在中美洲珊瑚礁生态区推广（扩大）的项目。这些项目的开发目的是在 3-5 年的时间跨度内显示出明确和可衡量的保护影响。每批学员都有一个与该地区保护需求相关的专题重点。例如，2010 年，研究员的项目侧重于沿海开发和旅游业；2011 年，侧重于可持续渔业和建立海洋保护区（MPA）；2012 年，侧重于建立多功能海洋保护区网络；2014 年，侧重于固体废物综合管理；2015 年，侧重于红树林生态系统服务的保护和经济评估。

量化红树林为当地社区提供的生态系统服务的价值是蓝碳项目的必要组成部分。这为生态系统服务补偿（PES）计划的设计提供了依据。由于全面评估具有挑战性且成本高昂，因此通过与当地社区的参与式协商过程来选择优先服务。原始数据在当地收集，并通过文献检索和访谈进行挖掘。结果向决策者强调了沿海-海洋生态系统的重要性，因为红树林的损失可以解释为资本损失。

研究人员、渔民和环境部在贝胡科地区建立了两个多用途海洋保护区，以更好地管理当地的鲷鱼种群。这些区域允许使用手工底层延绳钓（该地区鲷鱼渔民的首选渔具）和手钓，但不允许使用包括拖虾网在内的更多非选择性方法。哥斯达黎加的沿海海洋保护区最初是以前建立的陆地保护区的海洋延伸，贝胡科的海洋保护区也不例外。这些保护区的初衷是保护海龟免受拖网捕虾的伤害，但现在已发展成为更复杂的时空沿海资源管理工具。

该地区的海洋保护区提供了一个法律框架，保护当地渔民的利益免受工业化拖网捕虾船队的侵害（拖网捕虾船队以该地区的鲷鱼为目标，因为在哥斯达黎加捕虾在经济上并不可行）。哥斯达黎加正在制定由适应基金资助的气候变化适应战略。其中包括继续发展海洋保护区，并正在讨论扩大现有两个保护区的可行性。