El sistema de asociación y gestión de prefectura-condado-municipio-aldea está bajo la dirección del departamento competente en la materia y coopera con instituciones técnicas y de investigación especializadas a diferentes niveles. Es una asociación innovadora adaptada localmente que resuelve la integración entre la gestión tradicional y la moderna, así como los requisitos internacionales y nacionales.La Administración de Gestión del Patrimonio Cultural Mundial de HHRT es responsable a nivel prefectural de la comunicación y coordinación entre las instituciones internacionales y nacionales. El Gobierno de Yuanyang es el organismo encargado de la protección y gestión del patrimonio. Se ha creado una unidad especializada, el Comité de Gestión del Patrimonio Mundial de Yuanyang HHRT, para hacer cumplir el plan de gestión y ocuparse de los asuntos cotidianos en el sitio del Patrimonio Mundial. La ciudad de Panzhihua y el Comité de la Aldea de Yakou se encargan de ejecutar las actividades de conservación y de coordinarse con las partes interesadas locales. Entre 2012 y 2018, la prefectura encargó una investigación sobre los atributos y el sistema de gestión del agua de la aldea de Yakou, con el fin de comprender sus problemas subyacentes. Los sectores del condado llevaron a cabo la restauración del sistema de gestión del agua-madera basándose en los resultados de la investigación.

La investigación que Ecotrust y la asociación Kiiha llevaron a cabo fue esencial para comprender el contexto en el que operaban y los riesgos a los que se enfrentaba la empresa, lo que les permitió enmarcar su enfoque, argumento, estrategia y acciones de compromiso empresarial de forma más eficaz.

Durante la formación sobre compromiso empresarial impartida a través del programa Recursos Compartidos, Soluciones Conjuntas, las organizaciones de la sociedad civil ampliaron sus conocimientos sobre posicionamiento, negociación y diálogo. Por ejemplo, en lo que respecta al posicionamiento, al principio Ecotrust pensó en incentivar a Kinyara para que cumpliera los requisitos de la norma BonSucro y la alcanzara; un estudio mostró incluso que Kinyara no estaba muy lejos de los requisitos. Sin embargo, Ecotrust comprendió que la norma es un incentivo de mercado y ayuda a una empresa a acceder a un mercado al que antes no podía llegar; en el caso de Uganda, la industria azucarera está muy protegida, por lo que no hay valor añadido en obtener la certificación, ya que el precio seguiría siendo el mismo. Esto llevó a Ecotrust a cambiar de estrategia.

El Consejo de Gestión del Patrimonio Mundial se creó en 2012 y está compuesto por 8 miembros que representan a los principales grupos interesados en el bien del Patrimonio Mundial: 5 alcaldes de los 5 municipios -Røros, Tolga, Holtålen, Engerdal y Os-, 1 representante por cada uno de los 2 condados -Trøndelag e Innlandet (nivel regional)- y 1 representante del Parlamento Sami. El presidente ocupa el cargo durante 2 años y puede ser reelegido. El coordinador del Patrimonio Mundial actúa como secretario del consejo. Además, hay 6 observadores: el director de Destination Røros, el director del museo de Røros, el director del museo de Nord-Østerdal (3 municipios), el director del municipio de Røros, el gestor del patrimonio cultural de Røros y el gestor del sitio del Parque Nacional de Femundsmarka, que representa a ambos parques nacionales, y los gobernadores de los 2 condados. La junta celebra reuniones periódicas (4-5 veces al año) y excursiones en las que tramita los casos propuestos por el coordinador, por los propios miembros y por otras partes interesadas. Se debaten el plan de gestión, el presupuesto, las nuevas propuestas para reforzar los valores del sitio, la colaboración nacional e internacional y se escuchan las distintas sugerencias de las direcciones y departamentos. Las decisiones se toman por consenso.

Para establecer una zonificación funcional, es vital la conexión entre los distintos componentes del uso del suelo. La planificación del paisaje es una herramienta de integración y crea unas condiciones viables para aplicar una gestión basada en el pensamiento sistémico. El uso del modelo de la matriz parche-corredor de la ecología del paisaje permite la conectividad de los hábitats y la conservación de la biodiversidad.
La zonificación de la RBC identifica claramente que la zona núcleo es la AMP, encargada de proteger los bosques primarios de las islas y el paisaje marino. La zona de transición es el casco antiguo, y estos dos centros de conservación se conectan a través de la zona tampón de ríos, manglares, estuario y mar. Cada zona tendrá su propio plan de desarrollo basado en la zonificación principal del CBR. Concretamente, en la zona núcleo, el gobierno no permite la construcción de grandes hoteles, dando prioridad al desarrollo de casas de familia; las construcciones están restringidas en altura, materiales y procedimientos operativos para garantizar que no perturben el paisaje ecológico forestal y marino. En la zona de transición, el casco antiguo se preserva mediante normas de construcción. Todas las actividades socioeconómicas que tienen lugar en la zona de amortiguación se planifican basándose en la protección y promoción de los valores de los ecosistemas fluviales, de manglares y de playa.

El pensamiento sistémico es un enfoque científico que parte del todo. Se utiliza para diseñar reservas de biosfera individuales, pero también para conectarlas con toda la red internacional. Tiene en cuenta tanto las relaciones complejas como las variables "blandas" que sustentan las emociones, la motivación y el comportamiento humanos, proporcionando así un enfoque holístico de las complejas cuestiones políticas y sociales. Desde esta perspectiva, las reservas de la biosfera constan de varios componentes que reflejan relaciones complejas entre factores naturales y socioeconómicos, entre estructuras físicas y valores humanos, entre espacio cultural y paisaje natural, ecología política y ecología creativa. La aplicación del pensamiento sistémico se lleva a cabo desde la fase de preparación de la candidatura de una reserva de la biosfera hasta el diseño, la planificación de la gestión y la puesta en marcha. Aplicar el pensamiento sistémico al diseño de una reserva de la biosfera permite identificar todos los elementos del ecosistema más amplio. En el caso de la RBC, este enfoque permite conectar la ciudad antigua, influyente en el desarrollo de todo el ecosistema, como puerto histórico y su patrimonio cultural en relación con la zona marina protegida.

El Consejo de Administración de la RBC coordina todas las actividades relacionadas con los valores culturales y naturales de la Reserva de la Biosfera. En el procedimiento de desarrollo, la RBC intenta crear un lugar seguro para que las partes interesadas trabajen juntas y encuentren soluciones integradas. Una de las principales tareas del Consejo de Administración de la RBC es coordinar las diferentes designaciones internacionales y nacionales que incluyen la Reserva de la Biosfera, el sitio del Patrimonio Mundial, el patrimonio cultural inmaterial y el área marina protegida. El plan maestro y el programa de aplicación de la RBC están siempre en proceso de elaboración, actualización y coordinación con las partes interesadas, incluidas las cuatro entidades principales: gobierno, científicos, sector privado y población local. La mayoría de los dirigentes de la ciudad fueron invitados a formar parte del consejo de administración de la RBC. Esta es una característica importante del sistema que sirve para facilitar la recopilación de información y datos, debatir y reflexionar en talleres y reuniones, analizar problemas y encontrar soluciones al respecto. Todos los coordinadores de la RBC responden al equilibrio entre conservación y desarrollo, centrándose en el desarrollo sostenible y la resistencia al cambio climático.

Dada la heterogénea estructura de propiedad del distrito de los hortelanos, el establecimiento de asociaciones requirió mucho tiempo. Hubo que sentar a la mesa a representantes del Ayuntamiento y sus filiales (por ejemplo, Obras Municipales para el suministro de agua) junto con jardineros, propietarios de terrenos, asociaciones (como el Jardín del Patrimonio o la Sociedad del Regaliz) y amantes de la jardinería. El ayuntamiento se puso en contacto con las partes interesadas por escrito, por teléfono y organizó varias reuniones. Hubo que tener muy en cuenta la privacidad de los residentes y encontrar usos adecuados para los terrenos baldíos. En un caso, el fomento de la confianza se tradujo recientemente incluso en la conversión de un vivero abandonado en un centro comunitario, donde se celebran actos culturales, clases de cocina y exposiciones.

El sistema de conocimientos anishinaabe que portan y comparten los ancianos siempre ha dirigido la vida de la comunidad y las decisiones sobre la tierra. A través del Acuerdo de las Primeras Naciones, la gestión y ordenación del territorio y los procesos de nominación al Patrimonio Mundial, los guardianes del conocimiento de las Primeras Naciones Pimachiowin Aki empezaron a trabajar con científicos que añadían su sistema de conocimiento a los planes de las zonas tradicionales y a la nominación. El único proceso para el éxito fue establecer un diálogo regular entre ambos sistemas de conocimiento, y la participación a nivel comunitario de los Ancianos y otros guardianes del conocimiento, para garantizar que la voz de la comunidad fuera escuchada y documentada en los planes, el expediente de nominación y en todas las comunicaciones, a través de reuniones del grupo de trabajo comunitario sobre la tierra, reuniones de la Corporación Pimachiowin Aki, y reuniones de las Primeras Naciones y representantes del gobierno en la planificación de la gestión de la tierra y los equipos de implementación del plan. Los guardianes del conocimiento de la comunidad y los científicos aprendieron a entenderse. Fue un proceso largo y, con respeto mutuo y paciencia, conseguimos ponernos de acuerdo sobre la información que figuraba en los documentos. Este proceso sigue vigente hoy en día, con la participación de las comunidades cuando los gobiernos provinciales, las universidades y las organizaciones llevan a cabo proyectos de investigación en Pimachiowin Aki.

Además de contener patrimonio cultural designado en virtud de la Ley de Protección de Bienes Culturales aplicada por la Agencia de Asuntos Culturales, la propiedad contiene zonas que conforman el Parque Nacional de Yoshino-Kumano, cuya administración está a cargo del Ministerio de Medio Ambiente y las tres prefecturas que están relacionadas con él: Wakayama, Nara y Mie, y sus autoridades locales. El Consejo de las Tres Prefecturas para los Lugares Sagrados y Rutas de Peregrinación de la Cordillera de Kii, Patrimonio de la Humanidad, se creó en primer lugar para tramitar la candidatura a la Lista del Patrimonio Mundial y, tras la inscripción, se encarga de coordinar las acciones de conservación y desarrollar el plan de gestión. Los gobernadores de las tres prefecturas actúan como presidente y vicepresidente, mientras que los alcaldes y directores de educación de los municipios son miembros del consejo. La Agencia de Asuntos Culturales participa en calidad de observador. La protección de los bienes culturales se lleva a cabo en cooperación con el departamento de protección de bienes culturales y desarrollo regional de cada prefectura y el responsable del municipio. Además, el Consejo cuenta con el asesoramiento de un comité científico formado por expertos de diversos campos.