Ziel ist es, ein gutes grenzüberschreitendes Verständnis der nationalen Naturschutzsysteme und der Zusammenarbeit der beteiligten Personen und Organisationen auf trilateraler Ebene zu erlangen. Dieses tiefe Verständnis unterstützt die Verbesserung der Umsetzung eines koordinierten Managements und die Verknüpfung von nationalen mit trilateralen (und umgekehrt) Politiken, Plänen und Aktivitäten.
In der trilateralen Regierungszusammenarbeit hat jedes Land seine eigene politische Kultur und seine eigenen Prioritäten. Dies hat Einfluss auf die staatlichen und zivilgesellschaftlichen Strukturen und damit auf die Entscheidungsprozesse, was wiederum den Naturschutz und das Management beeinflusst.
Die nationalen Naturschutzstrukturen verdeutlichen, welches die verschiedenen öffentlichen Organisationen und die verschiedenen geopolitischen Ebenen sind, die für die Planung, die Politikgestaltung und die Umsetzung von Naturschutzaktivitäten vor Ort verantwortlich sind. Ebenfalls erforderlich war eine Definition der für den Naturschutz zuständigen Gebietsbetreuer, ihrer Aufgaben und Zuständigkeiten je Land. Diese Elemente müssen bei der Entwicklung eines transnationalen integrierten Managementplans (SIMP) unbedingt berücksichtigt werden.
Alle Gruppen mit Zuständigkeiten im Naturschutz sind in der trilateralen Verwaltungsstruktur vertreten. Einige im Entscheidungsgremium, dem Wadden Sea Board, und andere in den verschiedenen Arbeitsgruppen.
Es liegt im Interesse der mit dem Naturschutz befassten staatlichen Organisationen, ihre Rollen und Zuständigkeiten auf nationaler Ebene zu formulieren und zu klären. Dies hilft bei der Steuerung und Anpassung der Erwartungen sowie bei der Gestaltung einer trilateralen Struktur unter Einbeziehung der relevanten Nichtregierungsorganisationen und -gruppen.