La mayoría de las zonas boscosas de las montañas Kii se han plantado porque esta zona ha sido tradicionalmente un lugar de tala. Los árboles se talan cada 50 o 100 años y, tras la tala, la gente planta árboles pequeños. Esta estrategia tradicional de tala se viene realizando desde el siglo XVI con una técnica tradicional como la recogida de semillas, la plantación, la densidad de plantación, el aclareo y la tala, especialmente en el condado de Yoshino, en la prefectura de Nara, donde son características las cerezas. La prefectura de Nara también ha introducido un impuesto para la conservación del entorno forestal y colabora con voluntarios y organizaciones privadas a través de sus municipios para talar los bosques abandonados. Los bosques abandonados se han replantado con árboles de hoja ancha en lugar de coníferas como el cedro y el ciprés, que son adecuados para la silvicultura, y los bosques mixtos de coníferas y árboles de hoja ancha se están convirtiendo en bosques libres de intervención humana en el futuro. Paralelamente a la plantación y tala tradicional de árboles, intentamos mantener los bosques y el paisaje forestal de las montañas Kii de forma sostenible.

A lo largo de todo el proceso de designación de los lugares sagrados de las montañas Kii como patrimonio cultural y natural (como parte de un parque nacional), y su posterior inclusión en la Reserva de la Biosfera, para finalmente formar parte de los bienes del Patrimonio Mundial, se concedió oficialmente a las entidades religiosas su protección y gestión siguiendo los conocimientos tradicionales transmitidos durante siglos, basados en creencias religiosas y valores sagrados. Por ejemplo, debido a su carácter sagrado, los bosques primigenios han sido conservados bajo estrictas prohibiciones de tala por las diferentes comunidades religiosas. Los paisajes montañosos son interpretados como "mandalas" materializados por los budistas Shingon, y los practicantes de Shugendo reproducen los "mandalas" peregrinando y realizando sus prácticas ascéticas en estos entornos naturales. Para los peregrinos, las montañas Kii representan el paraíso en la tierra. Otro ejemplo es el bosque sagrado de Nachi, que ha sido designado "monumento natural" en virtud de la Ley de Protección de Bienes Culturales, y cuya gestión ha corrido a cargo del santuario sintoísta de Kumano Nachi, como parte de su lugar sagrado. La cascada de Nachi se considera sagrada. Esto significa que las aguas sagradas no pueden tocarse ni desviarse.

Además de contener patrimonio cultural designado en virtud de la Ley de Protección de Bienes Culturales aplicada por la Agencia de Asuntos Culturales, la propiedad contiene zonas que conforman el Parque Nacional de Yoshino-Kumano, cuya administración está a cargo del Ministerio de Medio Ambiente y las tres prefecturas que están relacionadas con él: Wakayama, Nara y Mie, y sus autoridades locales. El Consejo de las Tres Prefecturas para los Lugares Sagrados y Rutas de Peregrinación de la Cordillera de Kii, Patrimonio de la Humanidad, se creó en primer lugar para tramitar la candidatura a la Lista del Patrimonio Mundial y, tras la inscripción, se encarga de coordinar las acciones de conservación y desarrollar el plan de gestión. Los gobernadores de las tres prefecturas actúan como presidente y vicepresidente, mientras que los alcaldes y directores de educación de los municipios son miembros del consejo. La Agencia de Asuntos Culturales participa en calidad de observador. La protección de los bienes culturales se lleva a cabo en cooperación con el departamento de protección de bienes culturales y desarrollo regional de cada prefectura y el responsable del municipio. Además, el Consejo cuenta con el asesoramiento de un comité científico formado por expertos de diversos campos.

Para integrar la cultura ifugao en el currículo escolar formal, los profesores necesitan recibir formación sobre la cultura ifugao. Los profesores, en su mayoría de origen ifugao, han olvidado el sistema de valores de sus antepasados debido al sistema educativo moderno. Algunos han recibido formación fuera de la región de Ifugao. El objetivo es formar a los profesores en la integración de la cultura en las matemáticas, las ciencias sociales y todos los cursos, y diseñar materiales didácticos, módulos que incluyan la cultura ifugao como tema transversal. La formación de los profesores en materia de desarrollo curricular local y elaboración de módulos de aprendizaje está en curso.

Las terrazas arroceras de Ifugao son mantenidas por las familias, no sólo como zonas de producción de un cultivo básico, sino también por la razón sentimental de que estas propiedades han sido transmitidas por sus antepasados. El mantenimiento de las terrazas arroceras refleja principalmente un enfoque cooperativo de toda la comunidad que se basa en un conocimiento detallado de la rica biodiversidad existente en el agroecosistema de Ifugao, un sistema anual finamente sintonizado que respeta el ciclo lunar, la zonificación y la planificación, la conservación extensiva del suelo y el agua, el dominio del complejo régimen de control de plagas basado en el procesamiento de una variedad de hierbas, acompañado de rituales religiosos. Sin embargo, estos conocimientos están amenazados por los cambios socioculturales y la falta de implicación de la juventud, atraída por el modo de vida urbano globalizado. Para conservar las terrazas, es necesario reconocer la cultura ifugao y transmitir sus conocimientos indígenas a la siguiente generación. La estrategia sostenible propuesta por SITMo consiste en integrar la cultura y el patrimonio en los planes de estudios oficiales para poder salvaguardar la cultura ifugao.

El SITMo ha establecido asociaciones con instituciones científicas locales como la Universidad Estatal de Ifugao, que trabaja con el Sistema de Patrimonio Agrícola Mundial (SIPAM) de la FAO y ha creado el Centro de Investigación y Desarrollo del SIPAM de las Terrazas de Arroz de Ifugao. Además, en relación con esta iniciativa, el SITMo está trabajando en cooperación con la Universidad Estatal de Ifugao y el Ministerio de Ciencia y Tecnología de Taiwán y la Universidad Nacional Chengchi de Taiwán en el proyecto "Centro para el Conocimiento Indígena Taiwán-Filipinas, Conocimiento Local y Desarrollo Sostenible", en el que las instituciones asociadas están explorando juntas la salvaguardia sostenible y la transmisión de sus conocimientos indígenas a través del intercambio y la investigación colaborativa, lo que permitiría a las comunidades locales desarrollarse de forma sostenible. En 2012 se estableció una asociación a largo plazo con el Departamento de Antropología de la Universidad de California en Los Ángeles (UCLA) para llevar a cabo investigaciones arqueológicas en las terrazas, lo que condujo a la creación de galerías de patrimonio comunitario y a la publicación de artículos científicos.

Implicar a todas las partes interesadas en la conservación del paisaje cultural de las terrazas de arroz exigía reforzar las redes existentes, en las que los conocimientos tradicionales sobre la construcción y el mantenimiento de las terrazas, transmitidos por los ifugao, desempeñaban un papel fundamental para su recuperación y conservación sostenible. Como organización comunitaria en la que el 99% de sus miembros son los propios ifugaos y basada en el Movimiento Filipino de Reconstrucción Rural (PRRM), una ONG nacional que trabaja en proyectos de desarrollo comunitario, SITMo contaba con sólidos cimientos para el desarrollo de alianzas. Desarrolló asociaciones con la autoridad nacional y los gobiernos locales para implicar a las comunidades locales en el proceso de recuperación de las terrazas y desarrollar estrategias sostenibles para su conservación a largo plazo. El SITMo se centró en organizar a los agricultores de los distintos grupos del Patrimonio Mundial para debatir los problemas a los que se enfrentan las terrazas en grupos de discusión con las comunidades. Durante todo este tiempo, SITMo ha llevado a cabo investigaciones arqueológicas y etnográficas en cooperación con instituciones académicas como la UCLA, la Universidad de Filipinas y la Universidad Estatal de Ifugao.