Die meisten bewaldeten Gebiete in den Kii-Bergen wurden angepflanzt, weil dieses Gebiet traditionell ein Ort der Abholzung war. Die Bäume werden alle 50 bis 100 Jahre abgeholzt, und nach der Abholzung pflanzen die Menschen kleine Bäume. Diese traditionelle Abholzungsstrategie wird seit dem 16. Jahrhundert im Rahmen einer traditionellen Technik durchgeführt, die das Sammeln von Samen, das Pflanzen, die Pflanzdichte, das Ausdünnen und das Abholzen umfasst, insbesondere im Bezirk Yoshino in der Präfektur Nara, wo Kirschen charakteristisch sind. Die Präfektur Nara hat außerdem eine Steuer für die Erhaltung der Waldumwelt eingeführt und arbeitet über ihre Gemeinden mit Freiwilligen und privaten Organisationen zusammen, um verlassene Wälder abzuholzen. Die aufgegebenen Wälder wurden mit Laubbäumen anstelle von für die Forstwirtschaft geeigneten Nadelbäumen wie Zedern und Zypressen aufgeforstet, und Mischwälder aus Nadel- und Laubbäumen werden in Wälder umgewandelt, die in Zukunft frei von menschlichen Eingriffen sind. Parallel zur traditionellen Baumpflanzung und -ernte versuchen wir, die Wälder und die Waldlandschaft in den Kii-Bergen auf nachhaltige Weise zu erhalten.

Während des gesamten Prozesses, in dem die heiligen Stätten in den Kii-Bergen als Kultur- und Naturerbe (als Teil eines Nationalparks) ausgewiesen und später in das Biosphärenreservat aufgenommen wurden, um schließlich Teil des Weltkulturerbes zu werden, wurde den religiösen Körperschaften offiziell ihr Schutz und ihre Bewirtschaftung gewährt, und zwar nach dem seit Jahrhunderten überlieferten Wissen, das auf religiösen Überzeugungen und heiligen Werten beruht. So wurden beispielsweise die Urwälder aufgrund ihres heiligen Charakters von den verschiedenen Religionsgemeinschaften unter strengem Abholzungsverbot erhalten. Die Berglandschaften werden von den Shingon-Buddhisten als materialisierte "Mandalas" interpretiert, und die Shugendo-Praktizierenden reproduzieren "Mandalas", indem sie in diesen natürlichen Umgebungen pilgern und ihre asketischen Praktiken durchführen. Für die Pilger stellen die Kii-Berge das Paradies auf Erden dar. Ein weiteres Beispiel ist der heilige Wald von Nachi, der nach dem Gesetz zum Schutz von Kulturgütern als "Naturdenkmal" ausgewiesen ist und vom Shinto-Schrein Kumano Nachi als Teil seiner heiligen Stätte verwaltet wird. Der Nachi-Wasserfall gilt als heilig. Das bedeutet, dass das heilige Wasser nicht berührt oder umgeleitet werden darf.

Neben dem kulturellen Erbe, das nach dem Gesetz zum Schutz von Kulturgütern, das von der Kulturbehörde durchgesetzt wird, ausgewiesen ist, umfasst das Gebiet auch Gebiete, die dem Yoshino-Kumano-Nationalpark entsprechen, für dessen Verwaltung das Umweltministerium und die drei zugehörigen Präfekturen zuständig sind: Wakayama, Nara und Mie, sowie deren lokale Behörden. Der Rat der drei Präfekturen für die heiligen Stätten und Pilgerwege des Welterbes im Kii-Gebirge wurde zunächst gegründet, um die Nominierung für die Liste des Welterbes voranzutreiben, und nach der Eintragung ist er für die Koordinierung der Erhaltungsmaßnahmen und die Ausarbeitung des Managementplans zuständig. Die Gouverneure der drei Präfekturen fungieren als Vorsitzende und stellvertretende Vorsitzende, während die Bürgermeister und Schulleiter der Gemeinden als Mitglieder des Rates fungieren. Die Agentur für kulturelle Angelegenheiten nimmt als Beobachter teil. Der Schutz von Kulturgütern erfolgt in Zusammenarbeit mit der Abteilung für Kulturgüterschutz und Regionalentwicklung der jeweiligen Präfektur und dem Verantwortlichen der Gemeinde. Darüber hinaus wird der Rat von einem wissenschaftlichen Ausschuss beraten, der sich aus Experten verschiedener Bereiche zusammensetzt.

Um die Ifugao-Kultur in den formalen Lehrplan zu integrieren, müssen die Lehrer in der Ifugao-Kultur geschult werden. Die Lehrer, von denen die meisten aus Ifugao stammen, haben aufgrund des modernen Bildungssystems das Wertesystem ihrer Vorfahren vergessen. Einige wurden außerhalb der Ifugao-Region ausgebildet. Ziel ist es, Lehrer darin zu schulen, die Kultur in Mathematik, Sozialwissenschaften und alle anderen Fächer zu integrieren und Lernmaterialien und Module zu entwerfen, die die Kultur der Ifugao als Querschnittsthema enthalten. Die Lehrerschulungen zur Entwicklung lokaler Lehrpläne und zur Ausarbeitung von Lernmodulen sind im Gange.

Die Reisterrassen der Ifugao werden von den Familien nicht nur als Anbauflächen für ein Grundnahrungsmittel gepflegt, sondern auch aus dem sentimentalen Grund, dass diese Eigenschaften von ihren Vorfahren weitergegeben wurden. Die Erhaltung der Reisterrassen ist in erster Linie Ausdruck eines kooperativen Ansatzes der gesamten Gemeinschaft, der auf detaillierten Kenntnissen über die reiche biologische Vielfalt im Agrarökosystem der Ifugao, einem fein abgestimmten jährlichen System, das den Mondzyklus respektiert, sowie auf Zoneneinteilung und Planung, umfassender Boden- und Wassererhaltung und der Beherrschung des komplexen Schädlingsbekämpfungssystems, das auf der Verarbeitung einer Vielzahl von Kräutern basiert, beruht und von religiösen Ritualen begleitet wird. Dieses Wissen ist jedoch aufgrund des soziokulturellen Wandels und der mangelnden Beteiligung der Jugend, die von der urbanen, globalisierten Lebensweise angezogen wird, bedroht. Um die Terrassen zu erhalten, muss die Kultur der Ifugao anerkannt werden und das indigene Wissen der Ifugao an die nächste Generation weitergegeben werden. Die vom SITMo vorgeschlagene nachhaltige Strategie besteht darin, Kultur und kulturelles Erbe in den offiziellen Lehrplan zu integrieren, um die Ifugao-Kultur zu bewahren.

Das SITMo hat Partnerschaften mit lokalen wissenschaftlichen Einrichtungen wie der Ifugao State University aufgebaut, die mit dem FAO Globally Important Agricultural Heritage System (GIAHS) arbeitet und das Ifugao Rice Terraces GIAHS Research and Development Center gegründet hat. Darüber hinaus arbeitet das SITMo in Verbindung mit dieser Initiative mit der Ifugao State University, dem taiwanesischen Ministerium für Wissenschaft und Technologie und der National Chengchi University of Taiwan im Projekt "Center for Taiwan-Philippines Indigenous Knowledge, Local Knowledge and Sustainable Development" zusammen, in dem die Partnerinstitutionen gemeinsam die nachhaltige Sicherung und Weitergabe ihres indigenen Wissens durch Austausch und gemeinsame Forschung erforschen, was den lokalen Gemeinschaften eine nachhaltige Entwicklung ermöglichen würde. Im Jahr 2012 wurde eine langfristige Partnerschaft mit dem Fachbereich Anthropologie der University of California, Los Angeles (UCLA) geschlossen, um archäologische Untersuchungen auf den Terrassen durchzuführen, die zur Einrichtung von Galerien für das Gemeinschaftserbe und zur Veröffentlichung wissenschaftlicher Artikel führten.

Die Einbeziehung aller Interessengruppen in die Erhaltung der Kulturlandschaft der Reisterrassen erforderte die Stärkung bestehender Netzwerke, in denen das traditionelle Wissen der Ifugao über den Bau und die Instandhaltung der Terrassen eine zentrale Rolle für ihre Wiederherstellung und nachhaltige Erhaltung spielt. Als Gemeinschaftsorganisation, deren Mitglieder zu 99 % selbst Ifugaos sind und die sich auf das Philippine Rural Reconstruction Movement (PRRM) stützt, eine nationale NRO, die sich mit Projekten zur Gemeinschaftsentwicklung befasst, verfügte SITMo über eine solide Grundlage für die Entwicklung von Allianzen. Es entwickelte Partnerschaften mit der nationalen Behörde und den lokalen Regierungen, um die lokalen Gemeinschaften in den Prozess der Wiederherstellung der Terrassen einzubeziehen und nachhaltige Strategien für deren langfristige Erhaltung zu entwickeln. Das SITMo konzentrierte sich auf die Organisation von Bauern in den verschiedenen Welterbe-Clustern, um die Probleme der Terrassen in Fokusgruppen mit den Gemeinden zu diskutieren. Während der gesamten Zeit führte das SITMo in Zusammenarbeit mit akademischen Einrichtungen wie der UCLA, der University of the Philippines und der Ifugao State University kontinuierlich archäologische und ethnografische Forschungen durch.